染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(ChromatinImmunoprecipitation,簡(jiǎn)稱(chēng)ChIP)是研究活體內蛋白質(zhì)與DNA相互作用的一種技術(shù)。它利用抗原抗體反應的特異性,可以真實(shí)地反映體內蛋白因子與基因組DNA結合的狀況。隨著(zhù)對基因功能研究的不斷深入,這項技術(shù)正越來(lái)越多的被應用于科研的各個(gè)領(lǐng)域。
把生理狀態(tài)下的細胞內的DNA與蛋白質(zhì)交聯(lián)在一起,通過(guò)超聲或酶處理將染色質(zhì)切為小片段后,利用抗原抗體的特異性識別反應,將與目的蛋白相結合的DNA的片段沉淀下來(lái),然后可進(jìn)行后續的DNA序列測序鑒定等。
一是應該選擇能夠做ChIP實(shí)驗的抗體。盡量選擇ChIP級別商業(yè)化的抗體。如沒(méi)有,一般可以重組到帶有標簽的載體上,再轉染相應的宿主(目前市面上商業(yè)化的chip抗體只有300多種,因此正好找到對應抗體較困難,可以選擇標簽抗體)。
二是抗體的結合位點(diǎn)。選擇單抗的話(huà),盡量遠離抗原和染色質(zhì)相結合的位點(diǎn),這樣可以最大限度保證抗體和抗原的結合,而多抗可識別多個(gè)表位,可基本避免該風(fēng)險。因此單多抗各有優(yōu)缺點(diǎn),應重點(diǎn)關(guān)注該抗體是否經(jīng)過(guò)ChIP驗證。
三是抗體的濃度??贵w濃度的也很重要,濃度太低,不能與靶蛋白*結合。濃度太高會(huì )導致非特異性條帶增加背景。